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Enregistrement W2107656326 · doi:10.4049/jimmunol.179.2.837

Transcriptional Analysis of Clonal Deletion In Vivo

2007· article· en· W2107656326 sur OpenAlex
Troy A. Baldwin, Kristin A. Hogquist

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésBiologyClonal deletionNegative selectionT-cell receptorGeneNerve growth factor IBTransgeneCell biologyMajor histocompatibility complexGeneticsGene expressionCD8Clonal selectionTranscription factorT cellImmune systemImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Engagement of the TCR on CD4(+)CD8(+) thymocytes initiates either a program of survival and differentiation (positive selection) or death (clonal deletion), which is dictated in large part by the affinity of the TCR for self-peptide-MHC complexes. Although much is known about the factors involved in positive selection, little is understood about the molecular mechanism leading to clonal deletion. To gain further insight into this process, we used a highly physiological TCR transgenic mouse model to compare gene expression changes under conditions of nonselection, positive selection, and negative selection. We identified 388 genes that were differentially regulated in negative selection compared with either nonselection or positive selection. These regulated genes fall into many functional categories including cell surface and intracellular signal transduction, survival and apoptosis, transcription and translation, and adhesion and migration. Additionally, we have compared our transcriptional profile to profiles of negative selection in other model systems in an effort to identify those genes with a higher probability of being functionally relevant. These included three up-regulated genes, bim, nur77, and ian1, and one down-regulated gene, lip1. Collectively, these data provide a framework for understanding the molecular basis of clonal deletion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,086
Score d'incertitude au seuil0,572

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle