Adenylate Cyclase Mutations Rescue the <i>degP</i> Temperature-Sensitive Phenotype and Induce the Sigma E and Cpx Extracytoplasmic Stress Regulons in <i>Escherichia coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
Inactivation of the gene encoding the periplasmic protease DegP confers a high-temperature-sensitive phenotype in Escherichia coli. We have previously demonstrated that a degP mutant of E. coli strain CBM (W3110 pldA1) is not temperature sensitive and showed that this was most likely due to constitutive activation of the sigma E and Cpx extracytoplasmic stress regulons in the parent strain. In this study, further characterization of this strain revealed a previously unknown cryptic mutation that rescued the degP temperature-sensitive phenotype by inducing the extracytoplasmic stress regulons. We identified the cryptic mutation as an 11-bp deletion of nucleotides 1884 to 1894 of the adenylate cyclase-encoding cyaA gene (cyaAdelta11). The mechanism in which cyaAdelta11 induces the sigma E and Cpx regulons involves decreased activity of the mutant adenylate cyclase. Addition of exogenous cyclic AMP (cAMP) to the growth medium of a cyaAdelta11 mutant strain that contains a Cpx- and sigma E-inducible degP-lacZ reporter fusion decreased beta-galactosidase expression to levels observed in a cyaA+ strain. We also found that a cyaA null mutant displayed even higher levels of extracytoplasmic stress regulon activation compared to a cyaAdelta11 mutant. Thus, we conclude that the lowered concentration of cAMP in cyaA mutants induces both sigma E and Cpx extracytoplasmic stress regulons and thereby rescues the degP temperature-sensitive phenotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».