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Enregistrement W2108434880 · doi:10.1371/journal.pgen.1002313

Genetic Determinants of Serum Testosterone Concentrations in Men

2011· review· en· W2108434880 sur OpenAlexafffund
Claes Ohlsson, Henri Wallaschofski, Kathryn L. Lunetta, Lisette Stolk, John R. B. Perry, Annemarie Koster, Ann-Kristin Petersen, Joel Eriksson, Terho Lehtimäki, Ilpo Huhtaniemi, Geoffrey L. Hammond, Marcello Maggio, Andrea D. Coviello, Luigi Ferrucci, Margit Heier, Albert Hofman, Kate L. Holliday, John‐Olov Jansson, Mika Kähönen, David Karasik, Magnus K. Karlsson, Douglas P. Kiel, Ching‐Ti Liu, Östen Ljunggren, Mattias Lorentzon, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Thomas Meitinger, Dan Mellström, David Melzer, Iva Miljkovic, Matthias Nauck, Maria Nilsson, Brenda W.J.H. Penninx, Stephen R. Pye, Ramachandran S. Vasan, Martín Reincke, Fernando Rivadeneira, Abdelouahid Tajar, Alexander Teumer, André G. Uitterlinden, Jagadish Ulloor, Jorma Viikari, Uwe Völker, Henry Völzke, H.‐Erich Wichmann, Tsung-Sheng Wu, Wei Zhuang, Elad Ziv, Frederick C. W. Wu, Olli T. Raitakari, Anna L. Eriksson, Martin Bidlingmaier, Tamara B. Harris, Anna Murray, Frank H. de Jong, Joanne M. Murabito, Shalender Bhasin, Liesbeth Vandenput, Robin Haring

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2011
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal and reproductive studies
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingLeibniz-GemeinschaftCanadian Institutes of Health ResearchLeibniz-RechenzentrumWake Forest UniversityMinistry of Cultural AffairsNational Institutes of HealthBayerische Akademie der WissenschaftenGöteborgs UniversitetSiemensVetenskapsrådetBundesministerium für Bildung und ForschungNovo NordiskStiftelsen för Strategisk ForskningErasmus Medisch CentrumMünchner Zentrum für GesundheitswissenschaftenNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekJohns Hopkins UniversityErasmus Universiteit RotterdamNovo Nordisk FondenSchool of Medicine, Boston UniversityEuropean CommissionUniversität GreifswaldZonMw
Mots-clésSex hormone-binding globulinBiologyEndocrinologyInternal medicineTestosterone (patch)Single-nucleotide polymorphismAlleleLocus (genetics)AndrogenGeneticsGenotypeHormoneMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Testosterone concentrations in men are associated with cardiovascular morbidity, osteoporosis, and mortality and are affected by age, smoking, and obesity. Because of serum testosterone's high heritability, we performed a meta-analysis of genome-wide association data in 8,938 men from seven cohorts and followed up the genome-wide significant findings in one in silico (n = 871) and two de novo replication cohorts (n = 4,620) to identify genetic loci significantly associated with serum testosterone concentration in men. All these loci were also associated with low serum testosterone concentration defined as <300 ng/dl. Two single-nucleotide polymorphisms at the sex hormone-binding globulin (SHBG) locus (17p13-p12) were identified as independently associated with serum testosterone concentration (rs12150660, p = 1.2×10(-41) and rs6258, p = 2.3×10(-22)). Subjects with ≥ 3 risk alleles of these variants had 6.5-fold higher risk of having low serum testosterone than subjects with no risk allele. The rs5934505 polymorphism near FAM9B on the X chromosome was also associated with testosterone concentrations (p = 5.6×10(-16)). The rs6258 polymorphism in exon 4 of SHBG affected SHBG's affinity for binding testosterone and the measured free testosterone fraction (p<0.01). Genetic variants in the SHBG locus and on the X chromosome are associated with a substantial variation in testosterone concentrations and increased risk of low testosterone. rs6258 is the first reported SHBG polymorphism, which affects testosterone binding to SHBG and the free testosterone fraction and could therefore influence the calculation of free testosterone using law-of-mass-action equation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,123
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations227
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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