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Enregistrement W2108530098 · doi:10.4161/cc.25509

Metabolome and metaboproteome remodeling in nuclear reprogramming

2013· article· en· W2108530098 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueCell Cycle · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMayo Clinic
Mots-clésBiologyMetabolomeCell biologyReprogrammingInduced pluripotent stem cellGlycolysisBiochemistryMetabolomicsEmbryonic stem cellMetabolismCellBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nuclear reprogramming resets differentiated tissue to generate induced pluripotent stem (iPS) cells. While genomic attributes underlying reacquisition of the embryonic-like state have been delineated, less is known regarding the metabolic dynamics underscoring induction of pluripotency. Metabolomic profiling of fibroblasts vs. iPS cells demonstrated nuclear reprogramming-associated induction of glycolysis, realized through augmented utilization of glucose and accumulation of lactate. Real-time assessment unmasked downregulated mitochondrial reserve capacity and ATP turnover correlating with pluripotent induction. Reduction in oxygen consumption and acceleration of extracellular acidification rates represent high-throughput markers of the transition from oxidative to glycolytic metabolism, characterizing stemness acquisition. The bioenergetic transition was supported by proteome remodeling, whereby 441 proteins were altered between fibroblasts and derived iPS cells. Systems analysis revealed overrepresented canonical pathways and interactome-associated biological processes predicting differential metabolic behavior in response to reprogramming stimuli, including upregulation of glycolysis, purine, arginine, proline, ribonucleoside and ribonucleotide metabolism, and biopolymer and macromolecular catabolism, with concomitant downregulation of oxidative phosphorylation, phosphate metabolism regulation, and precursor biosynthesis processes, prioritizing the impact of energy metabolism within the hierarchy of nuclear reprogramming. Thus, metabolome and metaboproteome remodeling is integral for induction of pluripotency, expanding on the genetic and epigenetic requirements for cell fate manipulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,433
Score d'incertitude au seuil0,330

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle