MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2108679169 · doi:10.1128/jb.183.3.807-812.2001

MexR Repressor of the <i>mexAB-oprM</i> Multidrug Efflux Operon of <i>Pseudomonas aeruginosa</i> : Identification of MexR Binding Sites in the <i>mexA-mexR</i> Intergenic Region

2001· article· en· W2108679169 sur OpenAlexaff
Kelly Evans, Lateef Adewoye, Keith Poole

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCystic Fibrosis Foundation
Mots-clésBiologyOperonRepressorMutantPseudomonas aeruginosaMolecular biologyEffluxBiochemistryMicrobiologyTranscription factorGeneticsGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The MexR repressor of the mexAB-oprM multidrug efflux operon of Pseudomonas aeruginosa was purified as a C-terminal histidine-tagged protein by metal chelate affinity chromatography. The purified protein was shown to bind ca. 200 bp upstream of mexA, at two sites, each of which contains a repeat of the nucleotide sequence GTTGA in inverse orientation. DNA sequence analysis identified mexA and mexR promoters within the MexR binding regions, consistent with the previously observed negative regulation of mexR and mexAB-oprM expression by MexR. Transcription of mexA from the promoter originating within the MexR binding site II was confirmed and shown to be markedly enhanced in a nalB (i.e., mexR) mutant of P. aeruginosa. A second mexA promoter was also identified, ca. 70 bp upstream of mexAB-oprM, and transcription from this promoter appeared to occur in both the wild type and a nalB mutant. Production of MexAB-OprM in wild-type cells may be due to expression from a constitutively expressed proximal promoter, while MexAB-OprM hyperexpression in nalB mutants is due to the additional expression from a MexR-regulated distal promoter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,561

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations152
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of BacteriologyMême sujetBacterial Genetics and BiotechnologyTravaux en français237 207