MexR Repressor of the <i>mexAB-oprM</i> Multidrug Efflux Operon of <i>Pseudomonas aeruginosa</i> : Identification of MexR Binding Sites in the <i>mexA-mexR</i> Intergenic Region
Notice bibliographique
Résumé
The MexR repressor of the mexAB-oprM multidrug efflux operon of Pseudomonas aeruginosa was purified as a C-terminal histidine-tagged protein by metal chelate affinity chromatography. The purified protein was shown to bind ca. 200 bp upstream of mexA, at two sites, each of which contains a repeat of the nucleotide sequence GTTGA in inverse orientation. DNA sequence analysis identified mexA and mexR promoters within the MexR binding regions, consistent with the previously observed negative regulation of mexR and mexAB-oprM expression by MexR. Transcription of mexA from the promoter originating within the MexR binding site II was confirmed and shown to be markedly enhanced in a nalB (i.e., mexR) mutant of P. aeruginosa. A second mexA promoter was also identified, ca. 70 bp upstream of mexAB-oprM, and transcription from this promoter appeared to occur in both the wild type and a nalB mutant. Production of MexAB-OprM in wild-type cells may be due to expression from a constitutively expressed proximal promoter, while MexAB-OprM hyperexpression in nalB mutants is due to the additional expression from a MexR-regulated distal promoter.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».