Introducing mothur: Open-Source, Platform-Independent, Community-Supported Software for Describing and Comparing Microbial Communities
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Résumé
mothur aims to be a comprehensive software package that allows users to use a single piece of software to analyze community sequence data. It builds upon previous tools to provide a flexible and powerful software package for analyzing sequencing data. As a case study, we used mothur to trim, screen, and align sequences; calculate distances; assign sequences to operational taxonomic units; and describe the alpha and beta diversity of eight marine samples previously characterized by pyrosequencing of 16S rRNA gene fragments. This analysis of more than 222,000 sequences was completed in less than 2 h with a laptop computer.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
La notice
- Revue
- Applied and Environmental Microbiology
- Thématique
- Microbial Community Ecology and Physiology
- Domaine
- Environmental Science
- Établissements canadiens
- Dalhousie UniversityUniversity of British Columbia
- Organismes subventionnaires
- Alfred P. Sloan FoundationNational Science Foundation
- Mots-clés
- LaptopSoftwarePyrosequencingComputer scienceMetagenomicsData miningComputational biologyBiologySoftware engineeringGeneticsGeneProgramming languageOperating system
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui