Epigenetic regulation of glial fibrillary acidic protein by DNA methylation in human malignant gliomas
Notice bibliographique
Résumé
Glial fibrillary acidic protein (GFAP) is an intermediate filament expressed in glial cells that stabilizes and maintains the cytoskeleton of normal astrocytes. In glial tumors, GFAP expression is frequently lost with increasing grade of malignancy, suggesting that GFAP is important for maintaining glial cell morphology or regulating astrocytoma cell growth. Most permanent human glioma cell lines are GFAP negative by immunocytochemistry. Given that the GFAP gene is not mutated in human glioma specimens or glioma cell lines, we considered epigenetic mechanisms, such as promoter methylation, as a cause of silencing of GFAP in these tumors. In this study, we treated known GFAP-negative glioma cell lines with 5-aza-2'-deoxycytidine to examine GFAP promoter hypermethylation. Additionally, we performed bisulfite sequencing on primary glioma samples and glioma cell lines and showed an inverse relationship between GFAP promoter methylation status and GFAP expression. Using a gene reporter assay with the GFAP promoter cloned upstream of a luciferase gene, we showed that methylation of the GFAP promoter downregulates the expression of the luciferase gene. Our results suggest that epigenetic silencing of the GFAP gene through DNA methylation of its promoter region may be one mechanism by which GFAP is downregulated in human gliomas and glioma cell lines.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».