Use of PCR-Targeted Mutagenesis To Disrupt Production of Fusaricidin-Type Antifungal Antibiotics in <i>Paenibacillus polymyxa</i>
Notice bibliographique
Résumé
Paenibacillus polymyxa (formerly Bacillus polymyxa) PKB1 has been identified as a potential agent for biocontrol of blackleg disease of canola, caused by the pathogenic fungus Leptosphaeria maculans. The factors presumed to contribute to disease suppression by strain PKB1 include the production of fusaricidin-type antifungal metabolites that appear around the onset of bacterial sporulation. The fusaricidins are a family of lipopeptide antibiotics consisting of a beta-hydroxy fatty acid linked to a cyclic hexapeptide. Using a reverse genetic approach based on conserved motifs of nonribosomal peptide synthetases, a DNA fragment that appears to encode the first two modules of the putative fusaricidin synthetase (fusA) was isolated from PKB1. To confirm the involvement of fusA in production of fusaricidins, a modified PCR targeting mutagenesis protocol was developed to create a fusA mutation in PKB1. A DNA fragment internal to fusA was replaced by a gene disruption cassette containing two antibiotic resistance genes for independent selection of apramycin resistance in Escherichia coli and chloramphenicol resistance in P. polymyxa. Inclusion of an oriT site in the disruption cassette allowed efficient transfer of the inactivated fusA allele to P. polymyxa by intergeneric conjugation. Targeted disruption of fusA led to the complete loss of antifungal activity against L. maculans, suggesting that fusA plays an essential role in the nonribosomal synthesis of fusaricidins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».