Latent Conditional Individual-Level Models for Infectious Disease Modeling
Notice bibliographique
Résumé
Individual-level models (ILMs) have previously been used to model the spatiotemporal spread of infectious diseases. These models can incorporate individual-level covariate information, to account for population heterogeneity. However, incomplete or unreliable data are a common problem in infectious disease modeling, and models that are explicitly dependent on such information may not be robust to these inherent uncertainties. In this investigation, we assess an adaptation to a spatial ILM that incorporates a latent grouping structure based on some trait heterogeneous in the population. The resulting latent conditional ILM is then only dependent upon a discrete latent grouping variable, rather than precise covariate information. The posterior predictive ability of this proposed model is tested through a simulation study, in which the model is fitted to epidemic data simulated from a true model that utilizes explicit covariate information. In addition, the posterior predictive ability of the proposed ILM is also compared to that of an ILM that assumes population homogeneity. The application of these models to data from the 2001 UK foot-and-mouth disease epidemic is also explored. This study demonstrates that the use of a discrete latent grouping variable can be an effective alternative to utilizing covariate information, particularly when such information may be unreliable.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».