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Enregistrement W2109785566 · doi:10.6000/1927-520x.2013.02.03.4

Metagenomic Analysis of Uterine Microbiota in Postpartum Normal and Endometritic Water Buffaloes (Bubalus bubalis)

2013· article· en· W2109785566 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Buffalo Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueReproductive Physiology in Livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, India
Mots-clésBiologyFusobacteriaBacteroidetesFirmicutesPopulationMicrobiologyProteobacteriaBubalus16S ribosomal RNAGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Indian subcontinent the water buffalo (Bubalus bubalis) is one of the important livestock animals. As in cows, postpartum infection like endometritis in dairy buffaloes is major cause for the economic loss in the dairy industries. Till date, there is no study regarding metagenomic analysis of bacterial population of postpartum endometritic buffaloes. The purpose of this study was to identify and compare the uterine bacterial composition in normal and endometritic postpartum buffaloes using 16S rDNA cloning, which was a type of culture-independent methods. A total of 151 cloned plasmids for 16S rDNA from both normal and endometritic uterine samples were sequenced. Cloning library of 16S rDNA revealed clear cut difference between bacterial populations of normal and endometritic postpartum buffaloes. Cloned sequences were assigned to five major groups and one uncultured group. The five major groups include- Bacteroidetes, Firmicutes, Fusobacteria, Proteobacteria, and Tenericutes. Major cloned sequences from normal status endometrium were affiliated to phylum Proteobacteria, and most of the sequences showed high degree of similarity with bacteria Haemophilus felis. Most of the sequences from cloned library of endometritic status samples were affiliated to phylum Proteobacteria and Tenericutes. The most prevalent bacteria found in endometritic samples were Psychrobacter sp. PRwf-1, Psychrobacter pulmonis, Ureaplasma diversum strain T95 and Ureaplasma diversum strain A417. A major number of cloned sequences from both normal and endometritic samples were assigned to uncultured group. The present data showed bacterial population of postpartum normal and endometritic buffaloes and also described the presence of various types microbiota in uterine samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,882
Score d'incertitude au seuil0,370

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle