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Enregistrement W2110329117 · doi:10.1096/fj.13-227868

Differential type 1 interferon‐regulated gene expression in the brain during AIDS: interactions with viral diversity and neurovirulence

2013· article· en· W2110329117 sur OpenAlexafffund
Maria J. Polyak, Pornpun Vivithanaporn, Ferdinand Maingat, John G. Walsh, William G. Branton, Éric A. Cohen, Rick B. Meeker, Christopher Power

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Clinical Research InstituteUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGeneVirologyInterferonBiologyDifferential (mechanical device)Diversity (politics)Gene expressionGeneticsPhysicsSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The lentiviruses, human and feline immunodeficiency viruses (HIV‐1 and FIV, respectively), infect the brain and cause neurovirulence, evident as neuronal injury, inflammation, and neurobehavioral abnormalities with diminished survival. Herein, different lentivirus infections in conjunction with neural cell viability were investigated, concentrating on type 1 interferon‐regulated pathways. Transcriptomic network analyses showed a preponderance of genes involved in type 1 interferon signaling, which was verified by increased expression of the type 1 interferon‐associated genes, Mx1 and CD317 , in brains from HIV‐infected persons ( P <0.05). Leukocytes infected with different strains of FIV or HIV‐1 showed differential Mx1 and CD317 expression ( P <0.05). In vivo studies of animals infected with the FIV strains, FIV ch or FIV ncsu , revealed that FIV ch ‐infected animals displayed deficits in memory and motor speed compared with the FIV ncsu ‐ and mock‐infected groups ( P <0.05). TNF‐α, IL‐1β , and CD40 expression was increased in the brains of FIV ch ‐infected animals; conversely, Mx1 and CD317 transcript levels were increased in the brains of FIV ncsu ‐infected animals, principally in microglia ( P <0.05). Gliosis and neuronal loss were evident among FIV ch ‐infected animals compared with mock‐ and FIV ncsu ‐infected animals ( P <0.05). Lentiviral infections induce type 1 interferon‐regulated gene expression in microglia in a viral diversity‐dependent manner, representing a mechanism by which immune responses might be exploited to limit neurovirulence.—Polyak, M. J., Vivithanaporn, P., Maingat, F. G., Walsh, J. G., Branton, W., Cohen, E. A., Meeker, R., Power, C. Differential type 1 interferon‐regulated gene expression in the brain during AIDS: interactions with viral diversity and neurovirulence. FASEB J. 27, 2829‐2844 (2013). www.fasebj.org

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,568
Score d'incertitude au seuil0,684

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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