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Enregistrement W2110454603 · doi:10.1093/cid/civ439

Clinical Characteristics, Diagnosis, Management, and Outcomes of Disseminated Emmonsiosis: A Retrospective Case Series

2015· article· en· W2110454603 sur OpenAlexafffund
Ilan S. Schwartz, Nelesh P. Govender, Craig Corcoran, Sipho Dlamini, Hans Prozesky, Rosie Burton, Marc Mendelson, Jantjie Taljaard, Rannakoe Lehloenya, Greg Calligaro, Robert Colebunders, Chris Kenyon

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNail Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesVlaamse regeringFonds Wetenschappelijk OnderzoekAstellas PharmaAssociation of Medical Microbiology and Infectious Disease CanadaUniversity of Manitoba
Mots-clésMedicineInternal medicineInterquartile rangeRetrospective cohort studyCase fatality rateAmphotericin BBiopsyMortality rateGastroenterologySurgeryDermatologyEpidemiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: We describe the geographic distribution, clinical characteristics, and management of patients with disease caused by Emmonsia sp., a novel dimorphic fungal pathogen recently described in South Africa. METHODS: We performed a multicenter, retrospective chart review of laboratory-confirmed cases of emmonsiosis diagnosed across South Africa from January 2008 through February 2015. RESULTS: Fifty-four patients were diagnosed in 5/9 provinces. Fifty-one patients (94%) were human immunodeficiency virus coinfected (median CD4 count 16 cells/µL [interquartile range, 6-40]). In 12 (24%) of these, antiretroviral therapy had been initiated in the preceding 2 months. All patients had disseminated disease, most commonly involving skin (n = 50/52, 96%) and lung (n = 42/48, 88%). Yeasts were visualized on histopathologic examination of skin (n = 34/37), respiratory tissue (n = 2/4), brain (n = 1/1), liver (n = 1/2), and bone marrow (n = 1/15). Emmonsia sp. was cultured from skin biopsy (n = 20/28), mycobacterial/fungal and aerobic blood culture (n = 15/25 and n = 9/37, respectively), bone marrow (n = 12/14), lung (n = 1/1), lymph node (n = 1/1), and brain (n = 1/1). Twenty-four of 34 patients (71%) treated with amphotericin B deoxycholate, 4/12 (33%) treated with a triazole alone, and none of 8 (0%) who received no antifungals survived. Twenty-six patients (48%) died, half undiagnosed. CONCLUSIONS: Disseminated emmonsiosis is more widespread in South Africa and carries a higher case fatality rate than previously appreciated. Cutaneous involvement is near universal, and skin biopsy can be used to diagnose the majority of patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,856

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,398
Écart entre enseignants0,354 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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