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Enregistrement W2110500811 · doi:10.1111/j.1365-2958.2009.06915.x

Cytochrome P450 125 (CYP125) catalyses C26‐hydroxylation to initiate sterol side‐chain degradation in <i>Rhodococcus jostii</i> RHA1

2009· article· en· W2110500811 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSteroid Chemistry and Biochemistry
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchRijksuniversiteit GroningenMichael Smith Health Research BC
Mots-clésSterolRhodococcusBiologySide chainHydroxylationBiochemistrySteroidCholesterolCytochromeCholestanolMonooxygenaseMutantMicrobiologyCytochrome P450StereochemistryGeneChemistryEnzymeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cyp125 gene of Rhodococcus jostii RHA1 was previously found to be highly upregulated during growth on cholesterol and the orthologue in Mycobacterium tuberculosis (rv3545c) has been implicated in pathogenesis. Here we show that cyp125 is essential for R. jostii RHA1 to grow on 3-hydroxysterols such as cholesterol, but not on 3-oxo sterol derivatives, and that CYP125 performs an obligate first step in cholesterol degradation. The involvement of cyp125 in sterol side-chain degradation was confirmed by disrupting the homologous gene in Rhodococcus rhodochrous RG32, a strain that selectively degrades the cholesterol side-chain. The RG32 Omega cyp125 mutant failed to transform the side-chain of cholesterol, but degraded that of 5-cholestene-26-oic acid-3beta-ol, a cholesterol catabolite. Spectral analysis revealed that while purified ferric CYP125(RHA1) was < 10% in the low-spin state, cholesterol (K(D)(app) = 0.20 +/- 0.08 microM), 5 alpha-cholestanol (K(D)(app) = 0.15 +/- 0.03 microM) and 4-cholestene-3-one (K(D)(app) = 0.20 +/- 0.03 microM) further reduced the low spin character of the haem iron consistent with substrate binding. Our data indicate that CYP125 is involved in steroid C26-carboxylic acid formation, catalysing the oxidation of C26 either to the corresponding carboxylic acid or to an intermediate state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle