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Enregistrement W2110535287 · doi:10.1210/me.2014-1084

Minireview: Pioneer Transcription Factors in Cell Fate Specification

2014· review· en· W2110535287 sur OpenAlexafffund
Jacques Drouin

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2014
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyEpigenomeTranscription factorChromatinCell fate determinationCellular differentiationComputational biologyChromatin remodelingEpigeneticsCell biologyGeneBioinformaticsGeneticsGene expressionDNA methylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The specification of cell fate is critical for proper cell differentiation and organogenesis. In endocrine tissues, this process leads to the differentiation, often a multistep process, of hormone-producing cells. This process is driven by a combination of transcription factors (TFs) that includes general factor, tissue-restricted, and/or cell-restricted factors. The last 2 decades have seen the discovery of many TFs of restricted expression and function in endocrine tissues. These factors are typically critical for expression of hormone-coding genes as well as for differentiation and proper function of hormone-producing cells. Further, genes encoding these tissue-restricted TFs are themselves subject to mutations that cause hormone deficiencies. Although the model that emerged from these 2 decades is one in which a specific combination of TFs drives a unique cell specification and genetic program, recent findings have led to the discovery of TFs that have the unique property of being able to remodel chromatin and thus modify the epigenome. Most importantly, such factors, known as pioneer TFs, appear to play critical roles in programming the epigenome during the successive steps involved in cell specification. This review summarizes our current understanding of the mechanisms for pioneer TF remodeling of chromatin. Currently, very few TFs that have proven pioneer activity are known, but it will be critical to identify these factors and understand their mechanisms of action if we are to harness the potential of regenerative therapies in endocrinology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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