MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2111017750 · doi:10.1128/jcm.38.12.4412-4419.2000

Antigenic Diversity of <i>Haemophilus somnus</i> Lipooligosaccharide: Phase-Variable Accessibility of the Phosphorylcholine Epitope

2000· article· en· W2111017750 sur OpenAlexaff
Michael D. Howard, Andrew D. Cox, Jeffrey N. Weiser, Gerhardt G. Schurig, Thomas J. Inzana

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensNational Research Council CanadaInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopePhase variationBiologyAntigenic variationAntigenMonoclonal antibodyPhosphorylcholineMicrobiologyHaemophilusOligosaccharideAntibodyVirulenceBacteriaGeneticsBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The lipooligosaccharide (LOS) of Haemophilus somnus undergoes antigenic phase variation, which may facilitate evasion from the bovine host immune response and/or colonization and dissemination. However, LOS antigenic diversity in H. somnus has not been adequately investigated. In this study, monoclonal antibodies (MAbs) specific to various LOS epitopes were used to investigate antigenic variation and stability in LOS from H. somnus strains and phase variants. Clinical isolates of H. somnus exhibited intrastrain, as well as interstrain, antigenic heterogeneity in LOS when probed with MAbs to outer core oligosaccharide epitopes in an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). However, epitopes reactive with MAbs directed predominately to the inner core heptose region were highly conserved. At least one epitope, which was expressed in few strains, was identified. One LOS component affected by phase variation was identified as phosphorylcholine (PCho), which is linked to the primary glucose residue. Inhibition ELISA, immunoblotting, and electrospray-mass spectrometry were used to confirm that MAb 5F5.9 recognized PCho. LOS reactivity with MAb 5F5.9 was associated with loss of most of the outer core oligosaccharide, indicating that reactivity with PCho was affected by phase variation of the glucose residues in this region. Our results indicate that outer core epitopes of H. somnus LOS exhibit a high degree of random, phase-variable antigenic heterogeneity and that such heterogeneity must be considered in the design of vaccines and diagnostic tests.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical MicrobiologyMême sujetMicrobial infections and disease researchTravaux en français237 207