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Enregistrement W2111181123 · doi:10.3324/haematol.13359

Enhanced alternative splicing of the FLVCR1 gene in Diamond Blackfan anemia disrupts FLVCR1 expression and function that are critical for erythropoiesis

2008· article· en· W2111181123 sur OpenAlexaff
M.A. Rey, Simon P. Duffy, Jane Κ. Brown, James A. Kennedy, John E. Dick, Yigal Dror, C S Tailor

Notice bibliographique

RevueHaematologica · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensDiscovery CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiamond–Blackfan anemiaErythropoiesisBiologyIneffective erythropoiesisAlternative splicingHaematopoiesisCell biologyMyeloidMyelopoiesisAnemiaCancer researchStem cellGeneticsGeneRNAGene isoformInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Diamond-Blackfan anemia is a fatal congenital anemia characterized by a specific disruption in erythroid progenitor cell development. Approximately 25% of patients have mutations in the ribosomal protein RPS19 suggesting that Diamond-Blackfan anemia may be caused by a defect in ribosome biogenesis and translation. However, it is unclear how these defects specifically disrupt early erythropoiesis. Recent studies have shown that the retroviral receptor/heme exporter FLVCR1 is critical for early erythropoiesis. FLVCR1 null mice, despite dying in utero and having reduced myeloid and lymphoid cell growth, show a disruption in early erythropoiesis and have craniofacial and limb deformities similar to those found in some Diamond-Blackfan anemia patients. DESIGN AND METHODS: In this study, we recapitulated the Diamond-Blackfan anemia hematologic features of reduced erythropoiesis but normal myelopoiesis by disrupting FLVCR1 in human hematopoietic stem cells. RESULTS: We found that CD71(high) cells, which are enriched for immature erythroid cells, from Diamond-Blackfan anemia patients negative for RPS19 gene mutations express alternatively spliced isoforms of FLVCR1 transcript which encode proteins whose expression and function are disrupted. More importantly, our results suggest alternative splicing of FLVCR1 is significantly enhanced in Diamond-Blackfan anemia immature erythroid cells. Furthermore, we also observed enhanced FLVCR1 alternative splicing and a dramatic reduction of FLVCR1 protein expression in RPS19 down-regulated human K562 cells, which were used as a model to represent RPS19 gene mutated Diamond-Blackfan anemia. CONCLUSIONS: Taken together, our results suggest enhanced alternative splicing of FLVCR1 transcripts and subsequent FLVCR1 insufficiency as an additional contributing factor to the erythropoietic defect observed in Diamond-Blackfan anemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,305

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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