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Enregistrement W2111488265 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-14-2497

Germline Mutation in <i>BRCA1</i> or <i>BRCA2</i> and Ten-Year Survival for Women Diagnosed with Epithelial Ovarian Cancer

2014· article· en· W2111488265 sur OpenAlexaff
Francisco José Cândido dos Reis, Honglin Song, Ellen L. Goode, Julie M. Cunningham, Brooke L. Fridley, Melissa C. Larson, Kathryn Alsop, Ed Dicks, Patricia Harrington, Susan J. Ramus, Anna de Fazio, Gillian Mitchell, Sián Fereday, Kelly L. Bolton, Charlie Gourley, Caroline O. Michie, Beth Y. Karlan, Jenny Lester, Christine Walsh, Ilana Cass, Håkan Olsson, Martin Gore, Javier Benı́tez, María J. García, Irene L. Andrulis, Anna Marie Mulligan, Gord Glendon, Ignacio Blanco, Conxi Lázaro, Alice S. Whittemore, Valerie McGuire, Weiva Sieh, Marco Montagna, Elisa Alducci, Siegal Sadetzki, Angela Chetrit, Ava Kwong, Susanne K. Kjær, Allan Jensen, Estrid Høgdall, Susan L. Neuhausen, Robert L. Nussbaum, Mary B. Daly, Mark H. Greene, Jennifer T. Loud, Kirsten Moysich, Amanda E. Toland, Diether Lambrechts, Debra Frost, James D. Brenton, Marc Tischkowitz, Douglas F. Easton, Antonis C. Antoniou, Georgia Chenevix‐Trench, Simon A. Gayther, David D.L. Bowtell, Paul D.P. Pharoah

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversity Health NetworkLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCancer Research UKFrancis Crick Institute
Mots-clésGermlineOvarian cancerGermline mutationCancerEpithelial ovarian cancerGynecologyMedicineOncologyMutationInternal medicineCancer researchBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To analyze the effect of germline mutations in BRCA1 and BRCA2 on mortality in patients with ovarian cancer up to 10 years after diagnosis. EXPERIMENTAL DESIGN: We used unpublished survival time data for 2,242 patients from two case-control studies and extended survival time data for 4,314 patients from previously reported studies. All participants had been screened for deleterious germline mutations in BRCA1 and BRCA2. Survival time was analyzed for the combined data using Cox proportional hazard models with BRCA1 and BRCA2 as time-varying covariates. Competing risks were analyzed using Fine and Gray model. RESULTS: The combined 10-year overall survival rate was 30% [95% confidence interval (CI), 28%-31%] for non-carriers, 25% (95% CI, 22%-28%) for BRCA1 carriers, and 35% (95% CI, 30%-41%) for BRCA2 carriers. The HR for BRCA1 was 0.53 at time zero and increased over time becoming greater than one at 4.8 years. For BRCA2, the HR was 0.42 at time zero and increased over time (predicted to become greater than 1 at 10.5 years). The results were similar when restricted to 3,202 patients with high-grade serous tumors and to ovarian cancer-specific mortality. CONCLUSIONS: BRCA1/2 mutations are associated with better short-term survival, but this advantage decreases over time and in BRCA1 carriers is eventually reversed. This may have important implications for therapy of both primary and relapsed disease and for analysis of long-term survival in clinical trials of new agents, particularly those that are effective in BRCA1/2 mutation carriers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,448
Écart entre enseignants0,366 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations160
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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