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Enregistrement W2111490248 · doi:10.1210/me.2003-0025

RFX1 and NF-1 Associate with P Sequences of the Human Growth Hormone Locus in Pituitary Chromatin

2003· article· en· W2111490248 sur OpenAlexafffund
Lisa Norquay, Xiaoyong Yang, Patricia Sheppard, Scott Gregoire, Janice G. Dodd, Walter Reith, Peter A. Cattini

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChromatin immunoprecipitationBiologyMolecular biologyPromoterChromatinImmunoprecipitationLocus (genetics)HistoneRepressorTranscription factorTransfectionGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human GH family consists of five genes, including the placental chorionic somatomammotropins (CS), within a single locus on chromosome 17. Based on nuclease sensitivity, the entire GH/CS locus is accessible in pituitary chromatin, yet only GH-N is expressed. Previously, we reported a P sequence element (263P) capable of repressing placental CS promoter activity in transfected pituitary (GC) cells. Regions of protein binding within 263P include P sequence elements A and B (PSE-A and PSE-B), and we reported nuclear factor-1 (NF-1) recognition of PSE-B. We now provide evidence for multiple interactions on PSE-A, including binding of the regulatory factor X (RFX) family. Disruption of the RFX site within 263P blunts repressor activity in transfected GC cells; however, repression is only abolished when both PSE-A/RFX and PSE-B/NF-1 sites are mutated. The capacity of RFX and NF-1 to participate in a novel common complex is further suggested by coimmunoprecipitation of RFX1 and epitope-tagged NF-1 family members. Finally, we confirm the association of NF-1 and RFX1 with P sequences in human pituitary tissue by chromatin immunoprecipitation. Taken together, our data suggest that an inverse relationship exists between 263P and CS promoter histone hyperacetylation and the association of these factors in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,682

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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