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Enregistrement W2111644555 · doi:10.1152/physiolgenomics.00153.2004

DNA microarray analysis of gene expression in alveolar epithelial cells in response to TNFα, LPS, and cyclic stretch

2004· article· en· W2111644555 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePhysiological Genomics · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health NetworkSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyProinflammatory cytokineTumor necrosis factor alphaGene expressionSignal transductionChemokineCell biologyMicroarray analysis techniquesInflammationMolecular biologyImmunologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent evidence suggests that alveolar epithelial cells (AECs) may contribute to the development, propagation, and resolution of acute lung injury (ALI)/acute respiratory distress syndrome (ARDS). Proinflammatory cytokines, pathogen products, and injurious mechanical ventilation are important contributors of excessive inflammatory responses in the lung. In the present study, we used cDNA microarrays to define the gene expression patterns of A549 cells (an AEC line) in the early stages of three models of pulmonary parenchymal cell activation: cells treated with tumor necrosis factor-alpha (TNFalpha) (20 ng/ml), lipopolysaccharide (LPS, 1 microg/ml), or cyclic stretch (20% elongation) for either 1 h or 4 h. Differential gene expression profiles were determined by gene array analysis. TNFalpha induced an inflammatory response pattern, including induction of genes for chemokines, inflammatory mediators, and cell surface membrane proteins. TNFalpha also increased genes related to pro- and anti-apoptotic proteins, signal transduction proteins, and transcriptional factors. TNFalpha further induced a group of genes that may form a negative feedback loop to silence the NFkappaB pathway. Stimulation of AECs with mechanical stretch changed cell morphology and activated Src protein tyrosine kinase. The combination of TNFalpha plus stretch enhanced or attenuated expression of multiple genes. LPS decreased microfilament polymerization but had less impact on NFkappaB translocation and gene expression. Results from this study indicate that AECs can tailor their response to different stimuli or/and combination of stimuli and subsequently play an important role in acute inflammatory responses in the lung.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,195
Score d'incertitude au seuil0,572

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle