MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2111735661 · doi:10.1093/hmg/ddq558

SOX9 controls epithelial branching by activating RET effector genes during kidney development

2011· article· en· W2111735661 sur OpenAlexfundno aff
Antoine Reginensi, Michael J. Clarkson, Yasmine Neirijnck, Benson Lu, Takahiro Ohyama, Andrew K. Groves, Elisabeth Sock, Michael Wegner, Frank Costantini, Marie‐Christine Chaboissier, Andreas Schedl

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOulun YliopistoMedizinischen Hochschule HannoverMcGill UniversityEuropean CommissionAssociation pour la Recherche sur le CancerHarvard University
Mots-clésKidney developmentBiologySOX9NephronKidneyGlial cell line-derived neurotrophic factorUreteric budMesenchymeInternal medicineZebrafishCell biologyEndocrinologyGeneticsGeneGene expressionEmbryonic stem cellEmbryoMedicineReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital abnormalities of the kidney and urinary tract are some of the most common defects detected in the unborn child. Kidney growth is controlled by the GDNF/RET signalling pathway, but the molecular events required for the activation of RET downstream targets are still poorly understood. Here we show that SOX9, a gene involved in campomelic dysplasia (CD) in humans, together with its close homologue SOX8, plays an essential role in RET signalling. Expression of SOX9 can be found from the earliest stages of renal development within the ureteric tip, the ureter mesenchyme and in a segment-specific manner during nephrogenesis. Using a tissue-specific knockout approach, we show that, in the ureteric tip, SOX8 and SOX9 are required for ureter branching, and double-knockout mutants exhibit severe kidney defects ranging from hypoplastic kidneys to renal agenesis. Further genetic analysis shows that SOX8/9 are required downstream of GDNF signalling for the activation of RET effector genes such as Sprouty1 and Etv5. At later stages of development, SOX9 is required to maintain ureteric tip identity and SOX9 ablation induces ectopic nephron formation. Taken together, our study shows that SOX9 acts at multiple steps during kidney organogenesis and identifies SOX8 and SOX9 as key factors within the RET signalling pathway. Our results also explain the aetiology of kidney hypoplasia found in a proportion of CD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations135
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHuman Molecular GeneticsMême sujetRenal and related cancersTravaux en français237 207