Designing heterodimeric two‐stranded α‐helical coiled‐coils: the effect of chain length on protein folding, stability and specificity
Notice bibliographique
Résumé
The E/K coil, a heterodimeric coiled-coil, has been designed as a universal peptide capture and delivery system for use in applications such as biosensors and affinity chromatography. In this design, heterodimer formation is specified through the placement of charged residues at the e and g positions of the heptad repeat. The affinity and stability of the E/K coil has been modified in order to allow a greater range of conditions for association and dissociation by varying the chain length to obtain three, four and five heptad coiled-coils (21, 28 and 35 residues per polypeptide chain). The effect of chain length on stability and folding was examined by circular dichroism spectroscopy, guanidine hydrochloride denaturation, and redox equilibrium experiments. It was found that increases in chain length produced increases in the stability of heterodimeric coiled-coils, but in a nonlinear fashion. The resulting disulfide-bridged heterostranded molecules and reduced heterodimers span a wide range of stabilities (deltaG=3.3-11.9 kcal/mol), greatly expanding their scope for use in protein engineering and biomedical applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».