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Enregistrement W2112861733 · doi:10.1042/bj20020791

Characterization of the human topoisomerase IIβ (TOP2B) promoter activity: essential roles of the nuclear factor-Y (NF-Y)- and specificity protein-1 (Sp1)-binding sites

2002· article· en· W2112861733 sur OpenAlexafffund
Chun‐Nam Lok, Alexander J. Lang, S E Mirski, Susan P.C. Cole

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer therapeutics and mechanisms
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteTerry Fox Foundation
Mots-clésBiologyMolecular biologyTranscription factorPromoterTopoisomeraseChromatinTranscription (linguistics)Sp1 transcription factorGeneTransfectionDNAGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eukaryotic topoisomerase II (topo II) catalyses topological genomic changes essential for chromosome segregation, chromatin reorganization, DNA replication and transcription. Mammalian topo II exists as two isoforms, designated alpha and beta. Human topo IIalpha is an important cancer drug target, and an established determinant of drug sensitivity and resistance. Human topo IIbeta is also the target of anticancer drugs but its role in drug resistance is less clear. The two human topo II proteins are encoded by the TOP2A and TOP2B genes, respectively, which despite their highly conserved structural organization, are subject to distinctly different modes of regulation. In the present study, we have cloned and characterized the human TOP2B promoter containing a 1.3 kb fragment of the 5'-flanking and untranslated region (-1067 to +193). We found that the promoter activity of this TOP2B fragment was constant throughout the cell cycle, in contrast to the activity of the proximal promoter of TOP2A which was low in resting cells and enhanced during proliferation. Analyses of 5'-serially and internally deleted luciferase reporter constructs revealed that 80% of the TOP2B promoter activity could be attributed to the region between -533 and -481. Mutational analyses of putative regulatory elements indicated that two inverted CCAAT boxes (ICBs) within this region were essential for TOP2B promoter activity and gel mobility-shift assays indicated these sites bound the transcription factor nuclear factor-Y (NF-Y). Co-transfection experiments using a dominant-negative form of subunit A of NF-Y suggested that TOP2B promoter activity required direct interaction of NF-Y with the ICBs. In addition, a specificity protein-1 (Sp1)-binding GC box located just upstream of the ICBs was shown to contribute to TOP2B promoter activity in a synergistic manner with the ICBs. Our results suggest that the binding sites for NF-Y and Sp1 are critical for TOP2B transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,291

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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