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Enregistrement W2112899484 · doi:10.1128/iai.72.7.4172-4187.2004

Contribution of Gene Loss to the Pathogenic Evolution of <i>Burkholderia pseudomallei</i> and <i>Burkholderia mallei</i>

2004· article· en· W2112899484 sur OpenAlexaff
Richard A. Moore, Shauna Reckseidler-Zenteno, Sun Kim, William C. Nierman, Yan Yu, Apichai Tuanyok, Jonathan M. Warawa, David DeShazer, Donald E. Woods

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBurkholderia infections and melioidosis
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesU.S. Department of Defense
Mots-clésBurkholderia pseudomalleiBiologyMicrobiologyOperonVirulenceMelioidosisBurkholderiaGeneGeneticsArabinoseMutantBacteriaXyloseBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Burkholderia pseudomallei is the causative agent of melioidosis. Burkholderia thailandensis is a closely related species that can readily utilize l-arabinose as a sole carbon source, whereas B. pseudomallei cannot. We used Tn5-OT182 mutagenesis to isolate an arabinose-negative mutant of B. thailandensis. Sequence analysis of regions flanking the transposon insertion revealed the presence of an arabinose assimilation operon consisting of nine genes. Analysis of the B. pseudomallei chromosome showed a deletion of the operon from this organism. This deletion was detected in all B. pseudomallei and Burkholderia mallei strains investigated. We cloned the B. thailandensis E264 arabinose assimilation operon and introduced the entire operon into the chromosome of B. pseudomallei 406e via homologous recombination. The resultant strain, B. pseudomallei SZ5028, was able to utilize l-arabinose as a sole carbon source. Strain SZ5028 had a significantly higher 50% lethal dose for Syrian hamsters compared to the parent strain 406e. Microarray analysis revealed that a number of genes in a type III secretion system were down-regulated in strain SZ5028 when cells were grown in l-arabinose, suggesting a regulatory role for l-arabinose or a metabolite of l-arabinose. These results suggest that the ability to metabolize l-arabinose reduces the virulence of B. pseudomallei and that the genes encoding arabinose assimilation may be considered antivirulence genes. The increase in virulence associated with the loss of these genes may have provided a selective advantage for B. pseudomallei as these organisms adapted to survival in animal hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,712
Score d'incertitude au seuil0,600

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations118
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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