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Enregistrement W2113102893 · doi:10.1002/chem.201404283

Metalation Kinetics of the Human α‐Metallothionein 1a Fragment Is Dependent on the Fluxional Structure of the apo‐Protein

2014· article· en· W2113102893 sur OpenAlexaff
Gordon W. Irvine, Kelly Duncan, Meredith Gullons, Martin J. Stillman

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetalationChemistryCysteineCrystallographyKineticsStereochemistryMetalStoichiometryBiochemistryEnzymePhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mammalian metallothioneins are cysteine rich metal-binding proteins comprising, when fully metalated, two metal-binding domains: the α-domain binds with M4(II)S(Cys)11 stoichiometry and the β domain binds as M3(II)S(Cys)9 stoichiometry. While the fully metalated species have been widely studied, the metalation of the apoprotein is poorly understood. Key to a description of the metalation pathway(s) is the initial conformation of the apoprotein and the arrangement of the metal-coordinating cysteines prior to metalation. We report the effect of the ill-defined, globular structure of apoMT on metalation rates. In order to overcome the experimental limitations inherent in structural determinations of a fluxional protein we used a detailed analysis of the apo-α-metallothionein conformation based on the differential rate of cysteine modification with benzoquinone. The ESI mass spectral data show the presence of two distinct conformational families: one a folded conformational family at neutral pH and a second an unfolded family of conformations at low pH. The Cd(II) metalation properties of these two conformationally distinct families were studied using stopped-flow kinetics. Surprisingly, the unfolded apoprotein metalated significantly slower than the folded apoprotein, a result interpreted as being due to the longer time required to fold into the cluster structure when the fourth Cd(II) binds. These results provide the first evidence for the role of the structure of the apo-αMT in the metalation reaction pathways and show that cysteine modification coupled with ESI-MS can be used to probe structure in cysteine-rich proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,732

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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