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Enregistrement W2113759438

THE EFFECT OF PHOSPHORYLATION OF MOUSE SAMHD1 ON RESTRICTION OF HIV-1 AND MURINE LEUKEMIA VIRUS INFECTIONS

2015· article· en· W2113759438 sur OpenAlexfundno aff
Feifei Wang

Notice bibliographique

RevueThe Knowledge Bank (The Ohio State University) · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthYork UniversityNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesOhio State University
Mots-clésSAMHD1VirologyLeukemiaMurine leukemia virusHuman immunodeficiency virus (HIV)ImmunologyVirusMedicineBiologyCancer researchGeneticsReverse transcriptaseRNAGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The dNTPase SAMHD1 functions as an HIV-1 restriction factor in non-dividing cells by limiting intracellular dNTP levels required to complete viral reverse transcription. Phosphorylation of human SAMHD1 (hSAMHD1) at residue threonine (T) 592 by cyclin dependent kinase 1 (CDK1) and CDK2 impairs its restriction of HIV-1 infection. Mouse SAMHD1 (mSAMHD1) shares 72-74% protein sequence identity with hSAMHD1, and also restricts HIV-1 infection in non-dividing cells. However, it is unknown whether phosphorylation of mSAMHD1 regulates its restriction of retroviral infection.\nResults: We identified and confirmed that T634 is a phosphosite of mSAMHD1 in dividing cells by mass spectrometry and using a phospho-specific antibody. Using specific inhibitors of CDK1 and CDK2 decreased the level of T634 phosphorylated mSAMHD1 in dividing cells. We generated human U937 and mouse NIH3T3 cell lines stably expressing mSAMHD1 wild-type (WT), phospho-ablative (T634A) or phospho-mimetic (T634D) mutants to examine the effect of T634 phosphorylation on mSAMHD1-mediated restriction of HIV-1 or murine leukemia virus (MLV), respectively. In differentiated U937 cells, overexpression of mSAMHD1 WT or the mutants significantly restricted HIV-1 infection and reduced the intracellular dNTP levels. In dividing NIH3T3 cells, mSAMHD1 WT or the mutants modestly reduced MLV infection.\nConclusions: CDK1 and CDK2 phosphorylate T634 of mSAMHD1 in dividing cells. Restriction of HIV-1 infection in non-dividing cells and MLV infection in dividing cells by mSAMHD1 is independent of its T634 phosphorylation. Our results suggest different mechanisms of regulating retroviral restriction by hSAMHD1 and mSAMHD1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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