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Enregistrement W2114035431 · doi:10.1152/ajpregu.00088.2010

Genome duplication events have led to a diversification in the CPT I gene family in fish

2010· article· en· W2114035431 sur OpenAlexafffund
Andrea J. Morash, Christophe M. R. Le Moine, Grant B. McClelland

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Regulatory, Integrative and Comparative Physiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesMcMaster University
Mots-clésBiologyGene isoformGene duplicationRainbow troutGeneIsozymeGene familyTroutGeneticsGenomeFunctional divergenceBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The enzyme carnitine palmitoyltransferase (CPT) I is a major regulator of mitochondrial fatty acid oxidation in vertebrates. Numerous genome duplication events throughout evolution have given rise to three (in mammals) or multiple (in fish) genetically and functionally different isoforms of this enzyme. In particular, these isoforms represent a diversification of kinetic and regulatory properties stemming from mutations at the genomic and proteomic levels. Phylogenetic reconstructions reveal a comprehensive view of the CPT I family in vertebrates and genomic modifications leading to structural changes in proteins and functional differences between tissues and taxa. In a model fish species (rainbow trout), the presence of five CPT I isoforms suggests repeated duplication events in bony fishes and salmonids. Subsequently, an array of nucleotide and amino acid substitutions in the isoforms may contribute to a tissue-specific and a previously observed species-specific difference in the IC(50) for malonyl-CoA. Moreover, all five isoforms are expressed in trout at the mRNA level in skeletal muscle, heart, liver, kidney, and intestine. In general, transcript levels of the beta-isoforms were higher in muscle tissues, while levels of the alpha-isoforms were higher in other tissues. Rainbow trout also exhibit developmental plasticity in relative mRNA expression of CPT I isoforms from fry to juvenile to adult stage. Thus the evolution of CPT I has resulted in a very diverse family of isoforms. These differences represent a degree of specificity in the ability of species to regulate function at the protein and tissue levels, which, in turn, may allow for precise control of lipid oxidation in individual tissues during physiological perturbations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,729
Score d'incertitude au seuil0,869

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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