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Enregistrement W2114043064 · doi:10.1056/nejmoa1100102

<i>STAT1</i> Mutations in Autosomal Dominant Chronic Mucocutaneous Candidiasis

2011· article· en· W2114043064 sur OpenAlexaff
Frank L. van de Veerdonk, Theo S. Plantinga, Alexander Hoischen, Sanne P. Smeekens, Leo A. B. Joosten, Christian Gilissen, Peer Arts, Diana C. Rosentul, Andrew Carmichael, Chantal A.A. Smits-van der Graaf, Bart Jan Kullberg, J.W.M. van der Meer, Desa Lilić, Joris A. Veltman, Mihai G. Netea

Notice bibliographique

RevueNew England Journal of Medicine · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesZonMwEuropean Commission
Mots-clésChronic mucocutaneous candidiasisMucocutaneous zoneMedicineAutoimmunityImmunologyCandida albicansMucous membraneDermatologyGeneticsImmune systemPathologyDiseaseBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Chronic mucocutaneous candidiasis (CMC) is characterized by susceptibility to candida infection of skin, nails, and mucous membranes. Patients with recessive CMC and autoimmunity have mutations in the autoimmune regulator AIRE. The cause of autosomal dominant CMC is unknown. METHODS: We evaluated 14 patients from five families with autosomal dominant CMC. We incubated their peripheral-blood mononuclear cells with different combinations of stimuli to test the integrity of pathways that mediate immunity, which led to the selection of 100 genes that were most likely to contain the genetic defect. We used an array-based sequence-capture assay, followed by next-generation sequencing, to identify mutations. RESULTS: The mononuclear cells from the affected patients were characterized by poor production of interferon-γ, interleukin-17, and interleukin-22, suggesting that the defect lay within the interleukin-12 receptor and interleukin-23 receptor signaling pathways. We identified heterozygous missense mutations in the DNA sequence encoding the coiled-coil (CC) domain of signal transducer and activator of transcription 1 (STAT1) in the patients. These mutations lead to defective responses in type 1 and type 17 helper T cells (Th1 and Th17). The interferon-γ receptor pathway was intact in these patients. CONCLUSIONS: Mutations in the CC domain of STAT1 underlie autosomal dominant CMC and lead to defective Th1 and Th17 responses, which may explain the increased susceptibility to fungal infection. (Funded by the Netherlands Organization for Scientific Research and others.).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations656
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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