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Enregistrement W2114104841 · doi:10.1101/sqb.2011.76.010868

Control of Glycolysis through Regulation of PFK1: Old Friends and Recent Additions

2011· review· en· W2114104841 sur OpenAlexfundno aff
Inbal Mor, Eric C. Cheung, Karen H. Vousden

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology · 2011
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research UK
Mots-clésPhosphofructokinaseGlycolysisPhosphofructokinase 2Phosphofructokinase 1FructoseEnzymeMetabolismBiochemistryFructose 2,6-bisphosphateMetabolic pathwayBiologyFlux (metallurgy)Carbohydrate metabolismEnzyme activatorCell biologyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Regulation of glucose metabolism is a crucial aspect of cell physiology in normal and disease conditions. Many regulatory events are involved in determining the metabolic fate of glucose and the pathways into which it is directed. The first reaction that commits glucose to the glycolytic pathway is catalyzed by the enzyme phosphofructokinase-1 (PFK-1) and is tightly regulated. One of the most potent activators of PFK-1 is fructose 2,6 bisphosphate (F2,6BP) and its cellular levels are correlated with glycolytic flux. F2,6BP is synthesized and degraded by a family of bifunctional enzymes-the 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatases (PFKFB). The interplay among F2,6BP levels, the enzymes that generate and degrade it, and PFK-1 activity has important consequences for several different aspects of cell metabolism as well as for systemic metabolic conditions. TIGAR, a recently identified F2,6 bisphosphatase (F2,6BPase), could also contribute to this complexity and participate in shaping the metabolic profile of the cell.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations310
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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