Genetic diversity of mocó cotton (<i>Gossypium hirsutum</i>race<i>marie-galante</i>) from the northeast of Brazil: implications for conservation
Notice bibliographique
Résumé
Mocó cotton ( Gossypium hirsutum L. race marie-galante (Watt) Hutch.) is a potential source of valuable alleles for breeding programs, mainly because of its great adaptability to semi-arid conditions. With the aim of quantifying mocó cotton genetic variability, 187 plants collected in the northeast of Brazil were evaluated using 12 microsatellite markers. A total of 62 alleles were amplified, ranging from three to eight polymorphic alleles per locus. Total genetic diversity was high (0.52), and when measured on a per state basis, was of 0.37 on average. The population showed a low level of heterozygozity (HO= 0.16), reflecting a high level of endogamy (FIS= 0.67). Phylogenetic analysis using the neighbor-joining method revealed that plants sampled in different states tended to cluster according to their geographic origin, except for those collected in the states of Paraíba and Rio Grande do Norte, which grouped together. Plants from the state of Piauí formed two groups, one with an apparent allelic contribution from G. barbadense, while the second group of plants was closer to those from the states of Paraíba and Rio Grande do Norte. Despite the high genetic diversity that was observed in the remaining populations, urgent conservation efforts should be undertaken, owing to the high level of endogamy and accelerated extinction process that characterizes these populations. Such efforts should focus on the collection and ex situ maintenance of representative genetic diversity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».