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Enregistrement W2114501423 · doi:10.1152/ajplung.00027.2008

Gene expression in the developing diaphragm: significance for congenital diaphragmatic hernia

2008· article· en· W2114501423 sur OpenAlex
Robin D. Clugston, Wei Zhang, John J. Greer

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Lung Cellular and Molecular Physiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCongenital Diaphragmatic Hernia Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCongenital diaphragmatic herniaGeneBiologyDiaphragm (acoustics)GeneticsBioinformaticsFetus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital diaphragmatic hernia (CDH) is a frequently occurring birth defect and a source of potentially fatal neonatal respiratory distress. Recently, through the application of detailed karyotyping methods, several CDH-critical regions within the human genome have been identified. These regions typically contain several genes. Here we focused on genes from 15q26, the best-characterized CDH-critical region, as well as FOG2 and GATA4, genes singled out from CDH-critical regions at 8q22-8q23 and 8p23.1, respectively. We tested the hypothesis that these putative CDH-related genes are expressed within the developing diaphragm at the time of the hypothesized initial defect. Our results show that 15q26 contains a cluster of genes that are expressed in the developing rodent diaphragm, consistent with an association between deletions in this region and CDH. We then examined the protein expression pattern of positively identified genes within the developing diaphragm. Two major themes emerged. First, those factors strongly associated with CDH are expressed only in the nonmuscular, mesenchymal component of the diaphragm, supporting the hypothesis that CDH has its origins in a mesenchymal defect. Second, these factors are all coexpressed in the same cells. This suggests that cases of CDH with unique genetic etiology may lead to a common defect in these cells and supports the hypothesis that these factors may be members of a common pathway. This study is the first to provide a detailed examination of how genes associated with CDH are expressed in the developing diaphragm and provides an important foundation for understanding how the deletion of specific genes may contribute to abnormal diaphragm formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,529
Score d'incertitude au seuil0,882

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle