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Enregistrement W2114618700 · doi:10.1369/jhc.6a7129.2006

Hypoxia-inducible Factors in the First Trimester Human Lung

2006· article· en· W2114618700 sur OpenAlexaff
Frederick A. Groenman, Martin Rutter, Isabella Caniggia, Dick Tibboel, Martin Post

Notice bibliographique

RevueJournal of Histochemistry & Cytochemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensMount Sinai HospitalSickKids FoundationUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenCanadian Institutes of Health Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAryl hydrocarbon receptor nuclear translocatorBiologyVascular endothelial growth factorEpitheliumHypoxia (environmental)MesenchymeHypoxia-inducible factorsHIF1ALungAngiogenesisOrganogenesisParenchymaImmunohistochemistryHydroxylationPathologyEndocrinologyInternal medicineCancer researchTranscription factorChemistryImmunologyBiochemistryMedicineGeneVEGF receptorsAryl hydrocarbon receptorOxygen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lung development takes place in a relatively low-oxygen environment, which is beneficial for lung organogenesis, including vascular development. Hypoxia-inducible factor (HIF)-1 plays an important role in mediating oxygen-regulated events. HIF-1 is stable and initiates gene transcription under hypoxia, whereas in normoxia, interaction with the von Hippel-Lindau (VHL) tumor suppressor protein leads to rapid degradation of the HIF-1alpha subunit. Interaction with VHL requires hydroxylation of HIF-1alpha proline residues by prolyl hydroxylases (PHDs). We investigated the expression of the various components regulating HIF-1alpha stability in first trimester (8-14 weeks) human lungs. Spatial expression was assessed by immunohistochemistry and temporal expression by quantitative PCR. Immunoreactivity for PHD1, PHD3, and seven in absentia homolog (SIAH)1 was noted in the pulmonary epithelium. PHD2 was not expressed in the airway epithelium, but in the lung parenchyma. HIF-1alpha and vascular endothelial growth factor (VEGF) immunoreactivity were primarily detected in the branching epithelium. HIF-2alpha and ARNT proteins localized to the developing epithelium as well as mesenchymal, most likely vascular, structures in the parenchyma. VEGF receptor 2 (VEGFR2) was found in the subepithelium as well as in vascular structures of the mesenchyme. All components of the VEC complex (VHL, NEDD8, and Cullin2) were found in the epithelium. Quantitative PCR analysis demonstrated that VEGF, VEGFR1, HIF-1alpha, HIF-2alpha, ARNT, PHD1, PHD2, PHD3, and SIAH1 gene expression was constant during early pulmonary organogenesis. Cumulatively, the data suggest that the lung develops in a low-oxygen environment that allows for proper vascular development through HIF-regulated pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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