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Enregistrement W2114722760 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-07-4187

MDM2 Promoter Polymorphism and Pancreatic Cancer Risk and Prognosis

2008· article· en· W2114722760 sur OpenAlexaff
Kofi Asomaning, Amy E. Reid, Wei Zhou, Rebecca S. Heist, Rihong Zhai, Li Su, Eunice L. Kwak, Lawrence S. Blaszkowsky, Andrew X. Zhu, David P. Ryan, David C. Christiani, Geoffrey Liu

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésPancreatic cancerMedicineBiologyMdm2GeneticsOncologyCancer researchCancerInternal medicineBioinformaticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The mouse double minute 2 homologue (MDM2) -309T/G promoter polymorphism has been associated recently with the development and prognosis of a variety of tumors. The G allele is associated with increased affinity for Sp1 binding and higher MDM2 mRNA and protein levels, leading to diminished tumor suppressor activity of the p53 pathway. We hypothesized that the G allele is also associated with increased risk and worse outcome in pancreatic cancer. EXPERIMENTAL DESIGN: We evaluated the association between MDM2 309T/G and the risk of histologically confirmed pancreatic adenocarcinoma at Massachusetts General Hospital using unconditional logistic regression (123 cases and 372 controls). Complete overall survival and progression-free survival data were also available for 109 newly diagnosed patients. RESULTS: The adjusted odds ratios (95% confidence intervals) of pancreatic cancer associated with the MDM2 T/G and G/G genotypes compared with TT were 1.89 (1.20-2.99) and 2.07 (1.03-4.16), respectively (adjusting for age, gender, smoking status, and pack-years of smoking). In Cox proportional hazards model with the wild-type T/T genotype as the reference category and adjusting for stage, treatment, and performance status, both the heterozygous T/G and the homozygous G/G genotypes were associated with decreased progression-free survival [adjusted hazard ratio (95% confidence interval), 1.67 (0.98-2.84) for T/G and 2.28 (1.11-4.71) for G/G] and overall survival [2.64 (1.23-5.67) for T/G and 3.12 (1.22-7.91) for G/G]. CONCLUSIONS: The G allele of the MDM2 -309T/G polymorphism is associated with 2- to 3-fold increase risk and progression of pancreatic adenocarcinoma and a corresponding decrease in survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil0,708

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,205
Tête enseignante GPT0,476
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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