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Enregistrement W2115258056 · doi:10.1093/hmg/9.7.1041

Sequential deletion of C-terminal amino acids of the E1alpha component of the pyruvate dehydrogenase (PDH) complex leads to reduced steady-state levels of functional E1alpha2beta2 tetramers: implications for patients with PDH deficiency

2000· article· en· W2115258056 sur OpenAlexaff
Agnieszka Seyda

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical Acid Research Studies
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésBiologyPyruvate dehydrogenase complexAmino acidTerminal (telecommunication)BiochemistrySteady state (chemistry)Oxoglutarate dehydrogenase complexComponent (thermodynamics)Lactate dehydrogenaseEnzymePyruvate dehydrogenase phosphataseChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human pyruvate dehydrogenase (PDH) complex deficiency is an extremely heterogeneous disease in its presentation and clinical course. We have characterized novel mutations that affect the C-terminal portion of the PDH-E(1)alpha-coding sequence. Although the molecular defects underlying these mutations are different, both effectively produce a stop codon prematurely three amino acids from the C-terminus. The clinical and biochemical consequences of these mutations are unusual in that the affected individuals are very long-term survivors with PDH complex deficiency despite having low (<20%) activity in skin fibroblasts. These findings prompted us to investigate the C-terminus of E(1)alpha in greater detail. We constructed and expressed a series of PDH-E(1)alpha deletion mutants in a cell line with zero PDH complex activity due to a null E(1)alpha allele. Sequential deletion of the C-terminus by one, two, three and four amino acids resulted in PDH complex activities of 100, 60, 36 and 14%, respectively, compared with wild-type E(1)alpha expressed in PDH complex-deficient cells. The immunodetectable protein was decreased by the same amount as the activity, suggesting that the stability and/or assembly of the E(1)alpha(2)beta(2)heterotetramer might depend on the intactness of the PDH-E(1)alpha C-terminus. In addition, we compared the somatic and the testis-specific isoforms of E(1)alphaand concluded that they are biochemically equivalent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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