Germline analysis of thymidine/guanidine polymorphism at position 309 of the Mdm2 promoter in malignant melanoma patients
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
p53 is a major tumor suppressor gene, frequently mutated in human cancer, but rarely mutated in malignant melanoma (MM). Mdm2, the major negative regulator of p53, is overexpressed in 50-60% of MM patients, by an unknown mechanism. Single nucleotide polymorphism at position 309 of the Mdm2 promoter correlates with increased Mdm2 levels and reduced p53 activation. We speculated that guanine at position 309 (G309) of the Mdm2 promoter might be a cause of Mdm2 overexpression in MM patients, and associated with increased risk of MM. We aimed to estimate the prevalence of G309 in MM patients. Genomic DNA was collected from a cohort of 28 MM patients of various clinical stages. The relevant DNA stretch was sequenced and thymidine/guanidine polymorphism at position 309 of Mdm2 promoter was examined. We compared the resultant frequencies with the frequencies reported in the literature for the general population. The G allele frequency in the cohort of MM patients was 0.518. This frequency is high compared with the reported frequency of 0.351 in Caucasian healthy populations (odds ratio=1.98, P=0.014). It is also higher than a G allele frequency of 0.464 reported for Ashkenazi Jewish women, although this comparison was not statistically significant (odds ratio=1.14, P=0.76). These results suggest that the single nucleotide polymorphism G309 in the Mdm2 promoter might be an important genetic predisposing factor, and possibly indicate a molecular mechanism of disease regarding MM. These results must be confirmed in a larger cohort of MM patients and controls.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle