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Enregistrement W2115662673 · doi:10.1139/w09-012

Identification of oligopeptides mimicking the receptor-binding domain of Hantaan virus envelope glycoprotein from a phage-displayed peptide library

2009· article· en· W2115662673 sur OpenAlexvenueno aff
Xin Lü, Wen Yin, Yang Qiaoxin, Yingfeng Lei, Jing Yang, Mengning Sun, Min Yao, Zhikai Xu, Xiaoping Xue

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Vectors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycoproteinPeptide libraryPeptideBiologyMonoclonal antibodyMolecular biologyPeptide sequenceOligopeptideViral envelopePhage displayEpitopeReceptorVirologyAntibodyBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Attachment of enveloped viruses to cells is triggered by the receptor-binding domain (RBD) on envelope glycoproteins (GP) binding to receptors located on the cell surface. To date, recognized receptors and RBD of hantaan virus (HTNV) have not been exactly defined. In this study, one monoclonal antibody (MAb) 3G1 possessing high neutralizing activity, which is directed against HTNV envelope glycoprotein G2, was used to determine the crucial motif of RBD. Peptide ligands binding to MAb 3G1 were selected from a 12 amino acid peptide library displayed on filamentous phages. After 3 rounds of selection, the binding capacity between phages and MAb 3G1 was examined byELISA. Afterwards the positive phage clones with high binding activity to MAb 3G1 were chosen and sequenced. The peptide sequences of positive phage clones were compared with that of HTNV 76-118 strain G2. A motif Y/F/WPW(X)HX1-2HY, aligned to the primary sequences of G2 96YPWHTAKCHY105, was identified from the peptide inserts in the 9 positive clones. Positive phages and synthesized peptide containing the motif were bound significantly to virus-susceptible cell (Vero-E6) membranes by ELISA and immunofluorescence assay, respectively. Therefore, the sequence on G2 between amino acid 96 and 105 may be a key motif of HTNV RBD recognized by viral receptors on target cell membranes. Further characterization of the motif would provide useful information in understanding of the cellular entry of HTNV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,493

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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