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Enregistrement W2115792215 · doi:10.1096/fj.13-236075

Translational up‐regulation of polycystic kidney disease protein PKD2 by endoplasmic reticulum stress

2013· article· en· W2115792215 sur OpenAlexafffund
Jungwoo Yang, Wang Zheng, Qian Wang, Carlos J. Lara, Shaimaa Hussein, Xing‐Zhen Chen

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchKidney Foundation of Canada
Mots-clésEndoplasmic reticulumPolycystic kidney diseaseUnfolded protein responseMedicineDiseaseCell biologyInternal medicineBioinformaticsEndocrinologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) is caused by mutations in PKD1 or PKD2, and it affects over 10 million people worldwide. It is characterized by cyst formation in the kidney, liver and pancreas. Dosage changes in PKD1/PKD2 are important in ADPKD pathogenesis; therefore, their expression and function has to be strictly regulated. However, how they are regulated remain poorly understood. Recent studies have linked PKD2 regulation to endoplasmic reticulum (ER) stress that is implicated in neuronal, cardiac, and renal diseases. One major ER stress downstream is phosphorylation of eukaryotic initiation factor eIF2α by kinase PERK, which attenuates global protein translation and enhances translation of selected proteins. Here, we showed in several mammalian cell lines that PKD2 protein expression is up-regulated by different stresses that all increase phosphorylated eIF2α (P-eIF2α). Increasing P-eIF2α by overexpression or inhibiting the phosphatase activity resulted in increased PKD2. PCR and polysome-binding assays showed that ER stress does not affect the PKD2 mRNA level but increase its binding with ribosomes, indicating that P-eIF2α translationally up-regulates PKD2. By mutation analysis, we found that the upstream open reading frame (uORF) in the 5'-untranslated region of PKD2 mRNA represses PKD2 translation. Thus, ER stress and P-eIF2α translationally up-regulates PKD2 through bypassing the inhibitory uORF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,552

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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