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Enregistrement W2116294468 · doi:10.1186/1742-4690-10-25

The V86M mutation in HIV-1 capsid confers resistance to TRIM5α by abrogation of cyclophilin A-dependent restriction and enhancement of viral nuclear import

2013· article· en· W2116294468 sur OpenAlexafffund
Maxime Veillette, Katsiaryna Bichel, Paulina Pawlica, Stefan M.V. Freund, Mélodie B. Plourde, Quang Toan Pham, Carlos Reyes‐Moreno, Leo C. James, Lionel Berthoux

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchDarwin Trust of EdinburghCanada Research Chairs
Mots-clésCypaCyclophilin ACapsidMutantBiologyViral replicationVirologyCyclophilinRetrovirusHEK 293 cellsGeneticsMolecular biologyVirusGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: HIV-1 is inhibited early after entry into cells expressing some simian orthologues of the tripartite motif protein family member TRIM5α. Mutants of the human orthologue (TRIM5αhu) can also provide protection against HIV-1. The host protein cyclophilin A (CypA) binds incoming HIV-1 capsid (CA) proteins and enhances early stages of HIV-1 replication by unknown mechanisms. On the other hand, the CA-CypA interaction is known to increase HIV-1 susceptibility to restriction by TRIM5α. Previously, the mutation V86M in the CypA-binding loop of HIV-1 CA was found to be selected upon serial passaging of HIV-1 in cells expressing Rhesus macaque TRIM5α (TRIM5αrh). The objectives of this study were (i) to analyze whether V86M CA allows HIV-1 to escape mutants of TRIM5αhu, and (ii) to characterize the role of CypA in the resistance to TRIM5α conferred by V86M. RESULTS: We find that in single-cycle HIV-1 vector transduction experiments, V86M confers partial resistance against R332G-R335G TRIM5αhu and other TRIM5αhu variable 1 region mutants previously isolated in mutagenic screens. However, V86M HIV-1 does not seem to be resistant to R332G-R335G TRIM5αhu in a spreading infection context. Strikingly, restriction of V86M HIV-1 vectors by TRIM5αhu mutants is mostly insensitive to the presence of CypA in infected cells. NMR experiments reveal that V86M alters CypA interactions with, and isomerisation of CA. On the other hand, V86M does not affect the CypA-mediated enhancement of HIV-1 replication in permissive human cells. Finally, qPCR experiments show that V86M increases HIV-1 transport to the nucleus of cells expressing restrictive TRIM5α. CONCLUSIONS: Our study shows that V86M de-couples the two functions associated with CA-CypA binding, i.e. the enhancement of restriction by TRIM5α and the enhancement of HIV-1 replication in permissive human cells. V86M enhances the early stages of HIV-1 replication in restrictive cells by improving nuclear import. In summary, our data suggest that HIV-1 escapes restriction by TRIM5α through the selective disruption of CypA-dependent, TRIM5α-mediated inhibition of nuclear import. However, V86M does not seem to relieve restriction of a spreading HIV-1 infection by TRIM5αhu mutants, underscoring context-specific restriction mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,405
Score d'incertitude au seuil0,286

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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