Design of a novel polydactyl zinc finger with binding specificity for the proximal promoter region of PLN in the proposed treatment of cardiomyopathy.
Notice bibliographique
Résumé
Heart disease is the leading cause of death worldwide. Cardiomyopathy, a form of heart disease, is one of the many areas of clinical interest and is characterized as a disease of the heart myocardium. Phospholamban (PLN) is one of the many proteins linked with this disease. Its primary function in the cell is the inhibition of the sarco(endo)plasmic reticulum Ca2+ ATPase (SERCA2) calcium transporter located in muscle tissue. There is a direct causal link between when PLN is over-expressed, super-inhibitory or non-existent and the development of various forms of cardiomyopathy. In an effort to counteract the development of cardiomyopathy, we have designed a novel zinc finger protein named Dandy, which specifically binds form the –77 to -95 region of the proximal promoter of the PLN gene. This protein is expected to transiently block the binding of the NFY promoter and thus, the initiation of transcription. Blocking initiation of transcription should result in an overall decrease in the concentration of PLN. Dandy is a zinc finger protein made up of two three-fingered peptides. It recognizes a 18 bp sequence with a 1 bp gap in the middle. Tertiary structure predictions of Dandy show that the protein has the intended structure of the design. More clinical research into the specific binding interactions will need to be completed before in vivo function and overall efficacy of Dandy is elucidated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».