MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2116689164 · doi:10.1530/rep-11-0008

Aberrant DNA methylation at imprinted genes in testicular sperm retrieved from men with obstructive azoospermia and undergoing vasectomy reversal

2011· article· en· W2116689164 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueReproduction · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaB.C. Women's Hospital & Health CentreBritish Columbia Centre of Excellence for Women's Health
Organismes subventionnairesDivision of Materials ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAzoospermiaAndrologyGenomic imprintingObstructive azoospermiaDNA methylationMethylationMale infertilityImprinting (psychology)SpermTesticular sperm extractionVasectomyBiologySpermatogenesisInfertilityMedicineGeneticsGenePopulationPregnancyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Male factor infertility has been associated with abnormal DNA methylation at imprinted genes. Little information is available on the status of imprinting in the sperm of men with azoospermia, including the association between aberrant imprinting and obstructive azoospermia (OA) or non-OA (NOA). Analysis of DNA methylation at imprinted genes in the sperm of men undergoing vasectomy reversal would aid determination of whether aberrant imprinting is associated with obstruction. Testicular sperm was retrieved from testicular biopsies obtained from men with azoospermia (N=18), including OA (N=10), NOA (N=5), and unknown pathology (N=3), and from men undergoing vasectomy reversal (N=17). Sperm was also obtained from proven fertile men (N=9). DNA methylation was investigated at multiple CpG sites within the differentially methylated regions (DMRs) of three imprinted genes, H19, IG-GTL2 and MEST, using bisulphite sequencing. Unique clones representative of single cells were analyzed. We found a significant decrease in DNA methylation at the H19 DMR in testicular sperm of azoospermic men compared with proven fertile men. The decrease was also significant between OA and proven fertile men, and between men undergoing vasectomy reversal and proven fertile men, suggesting that aberrant DNA methylation may be associated with obstruction. Changes in DNA methylation at IG-GTL2 and MEST DMRs among groups were not significant. Our data suggest that imprinting abnormalities may be associated with obstruction and may occur in response to changes in testicular environment and not only spermatogenesis failure, as previously reported. Methylation at the H19 DMR was particularly prone to modification in testicular sperm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,234
Score d'incertitude au seuil0,572

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle