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Enregistrement W2116689979 · doi:10.5539/ijb.v1n2p101

Isolation and Characterization of a Silkworm cDNA Encoding a Protein Homologous to the 14kDa Protein of Bovine Ubiquinol-cytochrome C Reductase

2009· article· en· W2116689979 sur OpenAlexvenueno aff
Guangwei Xing, Jinghong Xing, Suhua Wang

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtein subunitBiochemistryBiologyReductaseComplementary DNAUbiquinolHomology (biology)Cytochrome cGenePeptide sequenceProtein primary structureMolecular biologyCytochrome bOpen reading frameCoenzyme Q – cytochrome c reductasePhylogenetic treeEnzymeMitochondrion

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, we characterized the small subunit of ubiquinol-cytochrome C reductase (Bmuccr) of the silkwormBombyx mori, a model insect of Lepidopteron species. The Bmuccr gene covers a 1.4 kb genome region and contains 3exons. The ORF contained 354bp and encoded 117 amino acid residues, which shares 69% overall amino acid sequenceidentities with the subunit VII of ubiquinol-cytochrome C reductase from bovine. Phylogenetic tree showed Bmuccr hadhigh homology with T. castaneum homologous. The multiple sequence alignment of 16 subunit VII homologues showsthat Bmuccr is very hydrophilic, has a characteristic charge distribution, and has a high helical content. Expressionanalysis indicated that Bmuccr was highly expressed in larva stage and was down-regulated in embryos stage and adultstage of silkworm. The tissue-specific expression indicated Bmuccr had high-expression level in tissues that consumeoxygen. The analysis of domain structure of this protein suggested that it might be involved in correct assembly of thecytochrome bcl complex. Definition of the homologous of bovine subunit VII of ubiquinol-cytochrome C reductaseshould facilitate further analysis of structure/function relationships of silkworm cytochrome bcl complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,242

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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