Insight into <i>S</i>-adenosylmethionine biosynthesis from the crystal structures of the human methionine adenosyltransferase catalytic and regulatory subunits
Notice bibliographique
Résumé
MAT (methionine adenosyltransferase) utilizes L-methionine and ATP to form SAM (S-adenosylmethionine), the principal methyl donor in biological methylation. Mammals encode a liver-specific isoenzyme, MAT1A, that is genetically linked with an inborn metabolic disorder of hypermethioninaemia, as well as a ubiquitously expressed isoenzyme, MAT2A, whose enzymatic activity is regulated by an associated subunit MAT2B. To understand the molecular mechanism of MAT functions and interactions, we have crystallized the ligand-bound complexes of human MAT1A, MAT2A and MAT2B. The structures of MAT1A and MAT2A in binary complexes with their product SAM allow for a comparison with the Escherichia coli and rat structures. This facilitates the understanding of the different substrate or product conformations, mediated by the neighbouring gating loop, which can be accommodated by the compact active site during catalysis. The structure of MAT2B reveals an SDR (short-chain dehydrogenase/reductase) core with specificity for the NADP/H cofactor, and harbours the SDR catalytic triad (YxxxKS). Extended from the MAT2B core is a second domain with homology with an SDR sub-family that binds nucleotide-sugar substrates, although the equivalent region in MAT2B presents a more open and extended surface which may endow a different ligand/protein-binding capability. Together, the results of the present study provide a framework to assign structural features to the functional and catalytic properties of the human MAT proteins, and facilitate future studies to probe new catalytic and binding functions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».