A Horizontally Acquired Transcription Factor Coordinates <i>Salmonella</i> Adaptations to Host Microenvironments
Notice bibliographique
Résumé
UNLABELLED: The transcription factors HilA and SsrB activate expression of two type III secretion systems (T3SSs) and cognate effectors that reprogram host cell functions to benefit infecting Salmonella in the host. These transcription factors, the secretion systems, and the effectors are all encoded by horizontally acquired genes. Using quantitative proteomics, we quantified the abundance of 2,149 proteins from hilA or ssrB Salmonella in vitro. Our results suggest that the HilA regulon does not extend significantly beyond proteins known to be involved in direct interactions with intestinal epithelium. On the other hand, SsrB influences the expression of a diverse range of proteins, many of which are ancestral to the acquisition of ssrB. In addition to the known regulon of T3SS-related proteins, we show that, through SodCI and bacterioferritin, SsrB controls resistance to reactive oxygen species and that SsrB down-regulates flagella and motility. This indicates that SsrB-controlled proteins not only redirect host cell membrane traffic to establish a supportive niche within host cells but also have adapted to the chemistry and physical constraints of that niche. IMPORTANCE: Expression of T3SSs typically requires a transcription factor that is linked in a genomic island. Studies of the targets of HilA and SsrB have focused on almost exclusively on T3SS substrates that are either linked or encoded in distinct genomic islands. By broadening our focus, we found that the regulon of SsrB extended considerably beyond T3SS-2 and its substrates, while that of HilA did not. That at least two SsrB-regulated processes streamline existence in the intracellular niche afforded by T3SS-2 seems to be a predictable outcome of evolution and natural selection. However, and importantly, these are the first such functions to be implicated as being SsrB dependent. The concept of T3SS-associated transcription factors coordinating manipulations of host cells together with distinct bacterial processes for increased efficiency has unrealized implications for numerous host-pathogen systems.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».