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Enregistrement W2117541395 · doi:10.1046/j.1365-2958.2000.01715.x

Expression cloning of the <i>Candida albicans CSA1</i> gene encoding a mycelial surface antigen by sorting of <i>Saccharomyces cerevisiae</i> transformants with monoclonal antibody‐coated magnetic beads

2000· article· en· W2117541395 sur OpenAlexafffund
Claude Lamarre, Noëlla Deslauriers, Yves Bourbonnais

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologySaccharomyces cerevisiaeCandida albicansMonoclonal antibodyCloning (programming)AntigenGeneMolecular biologyMicrobiologyAntibodyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mycelial surface antigen recognized by monoclonal antibody (mAb) 4E1 has previously been shown to be present predominantly in the terminal third of the hyphal structures in Candida albicans. We report here the expression cloning of the corresponding gene (CSA1 ) by mAb 4E1-coated magnetic beads sorting of Saccharomyces cerevisiae transformants expressing a C. albicans genomic library. The strategy is both highly selective and highly sensitive and provides an additional genetic tool for the cloning and characterization of C. albicans genes encoding surface proteins. CSA1 is an intronless gene encoding a 1203-residue protein composed of repetitive motifs and domains. Northern analysis indicates that CSA1 is preferentially expressed during the mycelial growth phase, although a low level of CSA1 mRNA can be detected in the yeast form. As evidenced by indirect immunofluorescence microscopy with mAb 4E1, Csa1p is not randomly distributed over the surface of yeast cells, but localizes predominantly in the growing buds. This suggests that the distribution of Csa1p may be restricted to sites of cell surface elongation. Both heterozygous and homozygous C. albicans csa1Delta mutants are viable. Upon induction of mycelial growth, the number and size of hyphal structures derived from the mutants are similar to those observed in the parental wild-type strain. The physiological role of Csa1p has yet to be determined. However, the presence in Csa1p of repeated cysteine-rich hydrophobic domains with significant sequence similarity to motifs found in surface proteins (Ag2 and Pth11) from two distantly related fungal pathogens (Coccidioides immitis and Magnaporthe grisea respectively) suggests a common function in host interaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,700

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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