Immunohistochemical study of BRAF V600E mutant protein expression in high-grade sarcomas
Notice bibliographique
Résumé
BRAF V600E is a mutation present in numerous neoplasms, including melanomas, thyroid, colorectal and ovarian carcinomas, gastrointestinal stromal tumors, and Langerhans’ cell histiocytosis. Vemurafenib, a BRAF V600E kinase inhibitor has been successfully used in the treatment of melanoma. The role of this mutation in unclassified high-grade sarcomas, malignancies with very limited treatment options, has not been widely studied. Because of the availability of a highly sensitive and specific antibody (VE1) against the BRAF V600E mutant protein, we tested 48 cases of unclassified high-grade sarcomas. Cytoplasmic expression intensity was graded as negative (0), or positive (2+ or 3+) by two pathologists and a pathology resident. Forty one out of 48 specimens remained intact in the cores after immunohistochemistry (IHC) processing. Six of the 41 cases (15%) were scored as positive. In addition, non-specific nuclear staining was detected in 12/88 cores (14%). The 6 positive cases were tested for the BRAF V600E mutation by RT-PCR, and all were negative. Based on these results, we concluded that BRAF V600E mutation is rare in unclassified high-grade sarcomas, and because of the non-specific staining, results should be interpreted with caution.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».