MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2118048714 · doi:10.1016/j.chembiol.2015.07.017

Inflammatory Signaling by NOD-RIPK2 Is Inhibited by Clinically Relevant Type II Kinase Inhibitors

2015· article· en· W2118048714 sur OpenAlexfundno aff
Peter Canning, Qui Ruan, Tobias Schwerd, Matouš Hrdinka, Jenny L. Maki, Danish Saleh, Chalada Suebsuwong, Soumya S. Ray, Paul E. Brennan, Gregory D. Cuny, Holm H. Uhlig, Mads Gyrd‐Hansen, Alexei Degterev, Alex N. Bullock

Notice bibliographique

RevueChemistry & Biology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistero dello Sviluppo EconomicoDanmarks Frie ForskningsfondOntario Ministry of Economic Development and InnovationOntario Genomics InstituteNational Institute of General Medical SciencesDiamond Light SourceWellcome TrustLudwig Institute for Cancer ResearchDeutsche ForschungsgemeinschaftGlaxoSmithKlineOntario GenomicsCrohn's and Colitis Foundation of AmericaGenome CanadaLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable TrustPfizerEli Lilly and Company
Mots-clésPonatinibPharmacologyInflammasomeAutophosphorylationChemistrySignal transductionProtein kinase AKinaseCancer researchInflammationCell biologyBiologyTyrosine kinaseDasatinibImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RIPK2 mediates pro-inflammatory signaling from the bacterial sensors NOD1 and NOD2, and is an emerging therapeutic target in autoimmune and inflammatory diseases. We observed that cellular RIPK2 can be potently inhibited by type II inhibitors that displace the kinase activation segment, whereas ATP-competitive type I inhibition was only poorly effective. The most potent RIPK2 inhibitors were the US Food and Drug Administration-approved drugs ponatinib and regorafenib. Their mechanism of action was independent of NOD2 interaction and involved loss of downstream kinase activation as evidenced by lack of RIPK2 autophosphorylation. Notably, these molecules also blocked RIPK2 ubiquitination and, consequently, inflammatory nuclear factor κB signaling. In monocytes, the inhibitors selectively blocked NOD-dependent tumor necrosis factor production without affecting lipopolysaccharide-dependent pathways. We also determined the first crystal structure of RIPK2 bound to ponatinib, and identified an allosteric site for inhibitor development. These results highlight the potential for type II inhibitors to treat indications of RIPK2 activation as well as inflammation-associated cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations126
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueChemistry & BiologyMême sujetImmune Response and InflammationTravaux en français237 207