MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2118284237 · doi:10.1093/database/bas036

Recent advances in biocuration: Meeting Report from the fifth International Biocuration Conference

2012· article· en· W2118284237 sur OpenAlexfundno aff
Pascale Gaudet, Cecilia N. Arighi, Frederic Bastian, Alex Bateman, Judith A. Blake, Mark J. Cherry, Peter D’Eustachio, ROBERT FINN, Michelle Giglio, Lynette Hirschman, Renate Kania, Wolfgang Andreas Klimke, María Martin, Ilene Karsch‐Mizrachi, Darren A. Natale, Claire O’Donovan, B. F. Francis Ouellette, Kim D. Pruitt, Marc Robinson‐Rechavi, Susanna‐Assunta Sansone, Paul N. Schofield, Granger Sutton, K. Van Auken, Sona Vasudevan, Cathy Wu, Jasmine Young, Raja Mazumder

Notice bibliographique

RevueDatabase · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteGeorge Washington UniversityWellcome TrustGeorgetown UniversityInstitute of GeneticsUniversity of OxfordOntario Institute for Cancer Research
Mots-clésLibrary scienceWorld Wide WebPromotion (chess)Political scienceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 5th International Biocuration Conference brought together over 300 scientists to exchange on their work, as well as discuss issues relevant to the International Society for Biocuration's (ISB) mission. Recurring themes this year included the creation and promotion of gold standards, the need for more ontologies, and more formal interactions with journals. The conference is an essential part of the ISB's goal to support exchanges among members of the biocuration community. Next year's conference will be held in Cambridge, UK, from 7 to 10 April 2013. In the meanwhile, the ISB website provides information about the society's activities (http://biocurator.org), as well as related events of interest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,025
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCommunication savante
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,991
Score d'incertitude au seuil0,133

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0250,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,009
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0090,007
Science ouverte0,0020,006
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0170,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDatabaseMême sujetBiomedical Text Mining and OntologiesTravaux en français237 207