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Enregistrement W2118290443 · doi:10.1139/b05-039

Population genetics of<i>Gaultheria shallon</i>in British Columbia and the implications for management using biocontrol

2005· article· en· W2118290443 sur OpenAlexvenueaboutno aff
Jennifer Wilkin, Simon F. Shamoun, Carol Ritland, Kermit Ritland, Yousry A. El‐Kassaby

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPopulationEcologyGenetic diversityDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gaultheria shallon Pursh. (salal), an ericaceous shrub native to the Pacific Northwest, often out-competes regenerating conifer species in managed forests. A naturally occurring fungus, Valdensinia heterodoxa Peyronel, is being considered as a potential biocontrol agent for salal. Knowledge of the genetic diversity and population structure of salal will help assess the effectiveness and the potential risks of using a biocontrol agent in natural populations. Salal samples were collected from five populations, four on Vancouver Island and one on coastal mainland British Columbia. DNA fingerprints were obtained based on 230 amplified fragment length polymorphisms (AFLPs), of which 99.1% were variable. While salal has been reported to be a polyploid, it is likely that over time it is moving toward a diploid state. Based on a comparison of allele frequencies with known diploids, the AFLP loci used in this study appear to follow a diploid pattern; however, the levels of variation reported in this study may be an underestimation depending on the ploidy of salal. An intensively sampled population on Vancouver Island (Shawnigan Lake) showed isolation by distance and low kinship correlations, indicative of more sexual reproduction than expected for a predominantly clonal population. Our findings suggest that salal may be clonal at a very local scale (less than 5 m), and that with high levels of diversity within populations and little differentiation among populations, developing an effective biocontrol for salal may be challenging.Key words: population structure, genetic diversity, AFLP, biocontrol, Gaultheria shallon.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,220

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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