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Enregistrement W2118317584 · doi:10.1139/b09-026

Molecular and functional characterization of<i>Brassica BREVIPEDICELLUS</i>orthologs involved in inflorescence architectureThis paper is one of a selection of papers published in a Special Issue from the National Research Council of Canada – Plant Biotechnology Institute.

2009· article· en· W2118317584 sur OpenAlexafffundvenueabout
Tim Dumonceaux, S. P. Venglat, Kumuda Kushalappa, Gopalan Selvaraj, Raju Datla

Notice bibliographique

RevueBotany · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensPlant Biotechnology Institute
Organismes subventionnairesNational Research Council Canada
Mots-clésBiologyInflorescenceArabidopsisBrassicaGeneticsBrassica oleraceaGeneBrassica rapaBotanyMutantArabidopsis thaliana

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diversity of inflorescence architecture in angiosperms relates to attracting pollinators and allowing the effective dispersal of seeds. Molecular understanding of the genetic factors regulating inflorescence architecture from the model system of Arabidopsis could provide critical insights for addressing this developmental process/pathway in a closely related crop species like Brassica napus L. Towards this objective, we have isolated and characterized the orthologs of the homeobox gene BREVIPEDICELLUS (BP) in three Brassica species, B. napus (BnBP), Brassica rapa L. (BrBP), and Brassica oleracea L. (BoBP). These Brassica orthologs show a high degree of conservation at the nucleotide and amino acid level, including the homeodomain and the intron positions. The B. napus ortholog complemented the Arabidopsis bp null allele and overexpression of BnBP in B. napus transgenic lines resulted in altered leaf phenotypes. Together, these results suggest that Brassica BP genes are functional orthologs of Arabidopsis BP. Ectopic expression of AS2, a negative regulator of BP encoding a LOB domain transcription factor, in transgenic B. napus produced compact inflorescence architecture reminiscent of the loss-of-function bp mutant phenotype described previously in Arabidopsis. These results provide evidence in support of BP as a potential target gene for modifying inflorescence architecture in Brassica crop species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2009
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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