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Enregistrement W2118584529 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.875.11

3D Visualization of the Glomerulus within Kidney Tissue made Transparent through Passive Optical Clearing

2015· article· en· W2118584529 sur OpenAlexaff
Tristan Conciatori, Martin Sandig, Alexandria De Santis‐Smith, Kem A. Rogers, Brian L. Allman

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAnatomy and Medical Technology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClearanceOptical sectioningKidneyGlomerulusPathologyConfocal microscopyVisualizationBiomedical engineeringConfocalMicroscopyAnatomyChemistryBiologyCell biologyComputer scienceMedicineOpticsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The understanding of structure/function relationships in complex cellular systems is enhanced by 3D visualization of their organization at microscopic resolution. Primarily for e-learning purposes, we recently used Amira 5.1 software to develop a digital 3D model of the renal corpuscle derived from serial histologically stained semi-thin sections. Since this technique is labour-intensive and time-consuming, in this study we applied the optical clearing method CLARITY to render kidney tissue optically transparent for 3D visualization of specific structures within the renal corpuscle by immunocytochemistry and confocal microscopy. Mouse kidneys were infused with a hydrogel solution to fix and cross-link protein. Cortical kidney tissue was then cut into 1mm thick sections and passively cleared for 40 days in clearing solution. The resultant optically transparent tissue was labelled for 4 days with primary antibodies against podocyte specific antigens such as nephrin, a transmembrane protein of the slit diaphragm, followed by incubation for 4 days with fluorescent secondary antibodies. 3D visualization by confocal microscopy provides detailed morphological information of the filtration barrier in the kidney glomerulus. High-resolution 3D imaging of complex cellular structures using passive optical clearing methods thus may prove useful for histology education and in histopathological inquiries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,665
Score d'incertitude au seuil0,192

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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