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Enregistrement W2118634531 · doi:10.1128/jvi.74.24.11504-11510.2000

Herpes Simplex Virus Type 1 ICP4 Promotes Transcription Preinitiation Complex Formation by Enhancing the Binding of TFIID to DNA

2000· article· en· W2118634531 sur OpenAlexfundno aff
Benoı̂t Grondin, Neal A. DeLuca

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthMedical Research Council Canada
Mots-clésTranscription factor II ATATA boxTAF1Transcription factor II DTranscription preinitiation complexBiologyTranscription factor II BMolecular biologyTAF2PromoterCell biologyGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infected-cell polypeptide 4 (ICP4) of herpes simplex virus type 1 (HSV-1) activates the expression of many HSV genes during infection. It functions along with the cellular general transcription factors to increase the transcription rates of genes. In this study, an HSV late promoter consisting of only a TATA box and an INR element was immobilized on a magnetic resin and incubated with nuclear extracts or purified TFIID in the presence and absence of ICP4. Analysis of the complexes formed on these promoters revealed that ICP4 increased the formation of transcription preinitiation complexes (PICs) in a TATA box-dependent manner, as determined by the presence of ICP4, TFIID, TFIIB, and polymerase II on the promoter. With both nuclear extract and purified TFIID, it was determined that ICP4 helped TFIID bind to the promoter and the TATA box. These observations differed from those for the activator Gal4-VP16. As previously observed by others, Gal4-VP16 also increased the formation of PICs without helping TFIID bind to the promoter, suggesting that ICP4 and VP16 differ in their mechanism of activation and that ICP4 functions to facilitate PIC formation at an earlier step in the formation of PICs. We also observed that the DNA binding activity of ICP4 was not sufficient to help TFIID bind to the promoter and that the region of ICP4 that was responsible for this activity is located between residues 30 and 274. Taken together these results demonstrate that a specific region of ICP4 helps TFIID bind to the TATA box and that this in turn facilitates the formation of transcription PICs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,204
Score d'incertitude au seuil0,820

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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